吐鲁番沙漠生态旅游线由海拔零点至中国海拔最低点——-164米的艾丁湖，以中国科学院吐鲁番沙漠植物园为核心，包含了海拔零点标志、设施农业观光园区、坎儿井休闲乐园(沙漠动植物馆)、沙漠植物分类标本园、柽柳专类园、民族草药圃、荒漠珍稀濒危植物迁地保护区、经济果木种质资源收集圃、沙漠景观观赏台、沙漠风情园、古城遗址区、艾丁湖湖区等多处景点。整个旅游路线将分三期建成，总投放2000万元，目前完成的第一期工程初具规模，达到向游客开放的目的。
吐鲁番沙漠生态旅游是新疆旅游企业依托科研单位进行旅游资源开发的首创，旅游路线的开发不仅为旅游名城吐鲁番增添了新的亮点，而且在宣传科技成果，提高公众素质、推动科研深入上将发挥重要作用。旅游路线在保障科学性前提下，努力提高观赏性、休闲性、趣味性，满足了人们“回归自然”的愿望，在提高公众环保意识和生态观念上也将发挥积极的作用。
