1997年根据文化遗产遴选标准C(II)(IV)(VI)被列入《世界遗产目录》。
巴拿马是欧洲人在美国太平洋海岸建立的第一个居民点，西班牙征服者帕卓若丝戴勒于1519年建成。为了保持早期街道的典型风貌，这片历史性的地区直到1671年后才开始发展。这里的建筑融合了西班牙、法国和美国早期的风格。艾利博多曾进行了一次不成功的尝试，试图把撒乐波利瓦尔建成一座多国陆地会议场所。
1501年，罗德里格斯·巴斯提达斯发现了巴拿马地峡。于是，这里成为欧洲人在太平洋海岸建立的第一个居民点，西班牙征服者帕卓若斯·戴勒于1519年在原来的一个印第安小渔村上建立了最初的巴拿马城。从此以后，巴拿马地峡特别是巴拿马城逐渐变成了一个大国际中心。巴拿马城几乎成为一个万花筒般的城市，居住有世界上各个地区的人，城里到处都可以发现历史与现代的碰撞与融合，这一点充分体现在它的三个组成部分：古城、老城和新城。
古城距新城中心八公里，现仅存那座最初的巴拿马城遗迹。1671年，英国海盗亨利·摩根洗劫并放火烧毁了巴拿马古城。穿过历史从林而留下来的，有圣母大教堂、圣何塞修道院、老市政府、奴隶市场、圣胡安医院等等。这些都是有"太平洋皇后"之称的巴拿马城的历史见证。随之保存下来的，还有传统的手工艺品。现在，在古城所在地建有一座博物馆。
老城又称殖民区，1673年重建，是殖民时期的印证：楼房、胡同、石街、教堂、博物馆，有西班牙式、法国式和意大利式三种风格并存，法国式和新古典式尤为突出。著名的低拱、大主教教堂就在这里。西班牙殖民时期的监狱现已成为艺苑、剧院、饭店等，还有鹭宫、内有金质大圣坛的圣何塞教堂等。巴拿马城约有居民60万，新城区高楼林立，设施齐全。
