环礁由4个大的珊瑚岛组成，岛内各怀抱一浅浅的礁湖，珊瑚岛群同时又被一珊瑚礁所包围。因其地理上与外界隔绝，常人难以到达，阿尔达布拉未受到人类的破坏，成为约2000只左右巨型龟的世外桃源，也是世界上最大的巨型龟所在地。
阿尔达布拉与非洲大陆和马达加斯加岛较为接近，导致比预想的更多的种群落户到这个海洋岛群。阿尔达布拉有引人注目的丰富的植物种群，有273种显花植物用蕨类，其中19种为地方种。该岛有一奇妙的昆虫群种，记录在案的就有1000多种，包括127种蝴蝶和蛾，其中36种是地方种。增加到地方种名单上的有陆蜗牛、某些甲壳类动物、塞舌尔飞狐、阿尔达布拉大龟以及只生活在雨水池塘中的淡水鱼。
由于阿尔达布拉与世隔绝，许多海鸟喜欢将其作为繁殖地。它是大、小军舰鸟在西印度洋的主要繁殖地，也供养了大量的红尾和白尾的热带鸟类，红脚鲣鸟和伪装鲣鸟以及在许多燕鸥中娇小玲珑的一种燕鸥。阿尔达布拉岛上最引人注目的两种鸟是阿尔达布拉薮莺和白猴秧鸡。阿尔达布拉薮莺发现于1968年，被认为仅局限于沿海灌丛的小范围内。发现它的时间虽短，但它肯定是世界上最珍稀的鸟类之一。白猴秧鸡也是阿尔达布拉的地方种，且是唯一残存的不会飞的鸟，这类鸟中还包括愚鸽（已绝种）。
