白云观的核心部分——丘祖殿。丘处机作为全真教创始人王重阳的徒弟,甚契玄机,潜心修道多年后成为全真教龙门派的创始人。他的遗蜕则埋藏于大殿内,大殿内有古树根雕成的巨钵,为乾隆所赐。柱上两幅对联云:悟道藏玄机四海驰名朕信宠,见君礼稽首一言止杀救苍生。雕中有一情节,说的是丘处机应成吉思汗相召,前往大漠军中进谒,和大汗谈论治理天下以及长生之道。据殿旁的说明记载历史上确实有这一史实,当年丘处机携弟子尹志平、李志常等18人跋山涉水,历时2年,到了西域,向成吉思汗进言统一天下者必在乎不嗜杀人。这次历程在《长春真人西游记》中有具体描述。止戈为武的道理,埋于三尺黄土下的成吉思汗不会不知道。当年,丘处机返回燕京后,他赐丘处机居于白云观的旧址——太极宫,真人羽化后,那个在书中“窃人之美”的尹志平重修了殿宇舍馆藏真人仙蜕。现在的白云观是在明初更名的。