萨迦寺就以其地土质呈灰白色而成名。萨迦，藏语意为“灰色土”，萨迦寺的建筑风格十分奇特，呈正方形，像一块魔方一般，体积约2万立方米，四周筑有围墙。寺墙很高，足有3丈四角建有碉楼，墙外还有一道人工挖的护城河，外墙粉刷成红、黑、白三色，这是西藏喇嘛教中萨迦派寺庙的特有标志。寺内主要建筑是大经堂，高约十米，其外貌和北京的故宫极为相似，殿内有40根粗大顶柱直通殿顶，此殿共使用了164根直径超过3米的朱红色木柱，气魄十分雄伟。建筑特点具有中国、印度、尼泊尔和西藏地方的风格，并使四者融为一体，和谐适宜。
萨迦寺位于日喀则西南130公里处的萨迦县城里，是萨迦派第一座寺院，由萨迦的创始人昆·贡却杰布于公元1073年创建。萨迦寺是全国重点文物保护单位之一。寺中艺术珍品浩瀚，文物价值又极高，因此被人们称为“第二个敦煌”。萨，藏语意为土；迦，藏语意为灰色，相传该地苯波山上的岩石风化后成为灰色的土，这就是萨迦地名的来历。
萨迦寺分南北两寺，以仲曲河为界，北寺修在北岸苯波山前，始建于宋神宗元丰二年（1079年），北寺规模宏大，为一片重叠逶迤的建筑群，在“文化大革命”中遭到毁灭性破坏。现在只有萨迦南寺尚存。星罗棋布的村舍沿山脚向平原展开，直至与县城连接起来。那些别致的房屋有秩序地排列着，古朴的街巷也很有规矩，这种形制独特的村舍在西藏可并不多见。
萨迦南寺坐落在日喀则地区萨迦县仲曲河南岸的平原上，始建于1268年，面积为14700平方米，平面呈正方形。有两圈城墙，城墙上有垛口，为了利于防守，除修有坚固的寺墙外，还修建了四个城堡和四个角楼，远远望去，对称、壮观。外面还有护城河，城门为“工”字形，整个平面图是大“回”字套着小“回”字，颇有一点战争防御的味道。城墙的颜色除了紫红色以外，还间有黑、白两色， 这是萨迦教派的重要标志。紫红色象征文殊菩萨，黑色象征金刚护法神，白色象征观音菩萨。三色成花,因而俗称“花教”。这在我区现存的古建筑中独具一格。
萨迦南寺的主体建筑为大经堂，面积5700平方米，高10米左右。殿内有40根粗犷的柱子直通殿顶，中间四根尤为粗大。我们量了一个柱子，其圆周边3.9米（直径1.21米），柱子下面刻有莲瓣纹的石础，圆周达5.2米（直径1.66米）。当地人给它们起了一些风趣的名字，如最粗的那根叫“加纳色钦嘎瓦”，意思是元朝送的柱子。大经堂的北面为“嵌东拉康”，里面有历代法王的银皮灵塔11座，均保存完好；大经堂的南侧为“蒲康”，是过去密宗念蒲巴终（金刚经）的场所。除上述建筑外，还有萨迦法王办公的“则金拉康”和喇嘛住房等。大殿内还供奉着释迦三世佛像和萨迦五祖，灵塔殿内还有历代萨迦法王的灵塔。这萨迦五祖在当地几乎妇孺皆知，很多人都能说上几段故事。萨迦教派一度是西藏占统治地位的教派，其领袖人物都出自昆氏家族。昆氏家族是吐蕃时期的老贵族世家，传说在赤松德赞时期，昆氏家族的人做过内相。贡乔杰布以后的五位萨迦派领袖被尊崇为萨迦五祖。
萨迦南寺的第二层，主要有平措颇章灵塔殿、卓玛颇章灵塔殿及专门珍藏各类藏文图书的“贝竹康”等建筑。
萨迦南寺内珍藏着大量具有历史和艺术价值的文物，如：封诰、印章、佛像等。在大经堂的通壁大经架上，存放着用金汁、朱砂等手抄的《甘珠尔》、《丹珠尔》等经书，二楼藏书室“贝竹康”内，珍藏着许多有关历史、医药、天文、地理、历算、文学以及名人传记等书籍，如保存了3，000多块上千年的梵文贝叶经，还有手工细致的壁画，萨迦寺的元代壁画总计有上万平方米，以萨迦法王像和曼陀罗最有特色，仅曼陀罗壁画就有130多幅。与敦煌不同的是，敦煌现时成为历史的遗物，而萨迦寺则一直薪火相传，生生不息。还保存着众多的历史文物，珍贵的有：元代中央政权给萨迦地方官员的封诰、印玺、冠戴、服饰，以及宋、元以来的佛象、法器、瓷器等。这些藏文典籍是藏族人民宝贵的文化遗产和精神财富。
萨迦教派是11世纪以昆氏家族为中心创立的，从13世纪中叶到14世纪中叶，曾经是西藏地方占统治地位的政治势力。在兴建萨迦南寺时，正值萨迦派领袖八思巴在元朝政府的支持下，取得了西藏地方政教统治权力之际，因此，不仅征调了西藏各地的大批民工，而且从内地也请来了很多工匠。藏汉劳动人民共同创造的这座宏伟建筑，是祖国兄弟民族在建筑艺术上合作的结晶。
